Ключевые сюжетные повороты первого сезона связаны с сущностью Амиры: она оказывается не демоном, а искусственно выведенным гибридом ангела Николь и демона, созданным магом Лавалем (Вельзевулом) в качестве живого ключа для пробуждения Бахамута. Дополнительным ударом становится предательство рыцаря Жиля де Ре, осквернившего разум Жанны д’Арк. В кульминации Genesis Фаваро вынужден поразить богоубийственным клинком саму Амиру: она растворяется в сиянии, дракон запечатывается, а взрывная волна отрывает герою ногу.
Во втором сезоне центральная интрига строится вокруг личности юноши «Криса», возлюбленного Нины, который оказывается тем самым деспотичным королём Шариосом XVII. Выясняется, что жестокая политика короля диктовалась сбором энергии для орудия «Дром» ради окончательного уничтожения Бахамута. В решающем противостоянии Кайсар погибает от рук заговорщиков, защищая монарха, но некромант Рита возвращает его в виде мыслящего зомби. Бахамут падает под совместным натиском, однако Шариос теряет зрение, а Нина — голос. В эпилоге Нина пишет Фаваро на песке послание «Спасибо» от лица Амиры, чья память навеки осталась в ткани мира.