Ключевой сюжетный поворот фильма заключается в том, что паук, укусивший Майлза Моралеса, был не из его вселенной (Земля-1610), а из другой — Земли-42. Это делает самого Майлза «изначальной аномалией», что и объясняет, почему он не вписывается в канон. Машина, которая должна была отправить его домой, сканирует ДНК паука и по ошибке отправляет Майлза на Землю-42.
Второй шокирующий твист ожидает его на Земле-42. В этой реальности нет Человека-паука, потому что паук оттуда укусил Майлза. Отец Майлза в этом мире мертв, а его место занял дядя Аарон. Когда Майлз пытается найти своего дядю, он сталкивается с шокирующим открытием: в этой вселенной Бродягой является не Аарон Дэвис, а сам Майлз Моралес с Земли-42. Таким образом, наш герой оказывается в ловушке в мире без Человека-паука, лицом к лицу со своей злой версией, в то время как Пятно готовится убить его отца в его родном мире. Фильм заканчивается тем, что Гвен Стейси, нарушив приказ Мигеля, собирает свою команду Пауков (включая Питера Б. Паркера, Паука-Нуар, Пени Паркер и Свина-паука), чтобы спасти Майлза.