Внимание: полные спойлеры.
Завязка. После стирания памяти о Питере в финале «Нет пути домой» герой живёт в полной изоляции. Его паучья ДНК внезапно меняется: чувства обостряются до дезориентации, в запястьях появляются органические паутинные железы. Питер вынужден сам исследовать собственную мутацию и пытаться вернуть организму прежний баланс. Вместе с физическими изменениями наружу прорывается ярость — эмоция, которая раньше была ему чужда.
Конфликт. Антагонист, способный овладевать чужим сознанием, вычисляет настоящую личность Питера и бьёт по единственному живому месту — по его чувствам к Эм-Джей, используя эту привязанность как отвлекающий манёвр, пока сам готовит проникновение в Департамент по контролю ущерба. Линия Эм-Джей устроена жёстко и честно: она не помнит Питера, и её прямота двигает сюжет — фильм даёт понять, что прежние отношения не восстанавливаются, а если она и полюбит его, то уже как другого человека.
Кульминация. Питер и Джин Грей сближаются на почве общей травмы: два человека, которых собственная сила сделала опасными для окружающих. В решающий момент Питер принимает за неё пулю, а Джин удерживает его в живых телепатически, работая как «психический аппарат искусственной вентиляции», пока рана затягивается. Это ключ ко всему фильму: спасение здесь — не результат превосходящей силы, а взаимный обмен. Долги обнулены, и Джин уезжает на север штата.
Финал. Питер выходит из истории не только с новыми способностями, но и с новым взглядом на себя. Он приходит на могилу тёти Мэй и вслух произносит то, к чему шёл четыре года изоляции: он больше не хочет делать это в одиночку. Затем он видит Неда в бодеге, подходит к нему — и Нед подсознательно повторяет их старое секретное рукопожатие. Питер, вооружённый полученным от Эм-Джей знанием настоящего имени Человека-паука, представляется, и Нед складывает два и два. Смысл сцены раскрывается ретроспективно: заклинание стёрло факты, но не стёрло связь — тело помнит то, чего не помнит память, и именно поэтому дружбу можно вернуть.
После титров. Впервые за девять лет в спайдер-фильме MCU нет сцены в середине титров. Единственный короткий эпизод после титров показывает, как приложение Неда Spidey Tracker ловит сигнал, уносящийся из Нью-Йорка в глубокий космос, а затем появляется титр о том, что Человек-паук вернётся. Смысл прозрачен: героя, только что вернувшего себе право на обычную человеческую жизнь, вот-вот втянут в мультивселенский конфликт — и эта ирония, судя по реакции зрителей, работает и как задел, и как тревожный сигнал.