"Волчьи дети Амэ и Юки" — это история о выборе, и главный сюжетный поворот заключается в том, как диаметрально меняются пути детей. Изначально Юки, бойкая и дикая, кажется предназначенной для жизни в природе, в то время как слабый и пугливый Амэ ищет защиты у матери. Однако взросление кардинально меняет их приоритеты.
Ключевой твист — это инверсия их характеров. Юки, столкнувшись с необходимостью социализации в школе, начинает бояться и презирать свою волчью сущность. Переломным моментом становится инцидент, когда она в волчьем обличье случайно ранит одноклассника Сохэя. Этот страх быть раскрытой и отвергнутой заставляет её окончательно выбрать путь человека. Позже она открывает свою тайну Сохэю, и он принимает её, говоря, что и так всё знал, что укрепляет её решение жить в мире людей.
Амэ, наоборот, находит себя в дикой природе. Его наставником становится старый лис, хранитель горы. Амэ всё больше отдаляется от человеческого мира и школы, чувствуя свою ответственность перед лесом. Кульминация и концовка наступают во время сильной бури. Хана пытается удержать Амэ, которому всего 10 лет, но он уже сделал свой выбор. Он уходит в лес, чтобы занять место своего умершего учителя и стать новым хранителем горы. Хана, после мучительных поисков и падения со скалы, в полусне видит своего возлюбленного, который уверяет её, что она прекрасно вырастила их детей. Она принимает выбор сына и с улыбкой отпускает его, а вскоре и Юки, которая уезжает учиться в среднюю школу и жить в общежитии. Финальная улыбка Ханы, оставшейся одной в пустом доме, символизирует не одиночество, а исполненный материнский долг: она вырастила детей и позволила им найти собственное счастье, каким бы разным оно ни было.