Сюжетные линии проекта разделяются на неканоническую ветку и каноническую адаптацию манги:
- События 1–2 сезонов (Неканон): в первом сезоне выясняется, что за заговором против семьи Фантомхайв стоял падший ангел Эш/Анджела. Во втором сезоне представлена альтернативная пара — граф Алоис Транси и демон-паук Клод Фаустус. В финале из-за желания Алоиса Сиэль перерождается в демона, лишая Себастьяна долгожданной награды (души) и навечно привязывая его к себе в качестве слуги.
- Каноническая линия манги:
- В арке цирка разоблачается сеть торговли детьми во главе с бароном Кельвином, мечтавшим воссоздать ритуал жертвоприношения.
- Гробовщик оказывается Жнецом-дезертиром, создающим оживших мертвецов («бисовантов») путём внедрения фальшивых кадров в их кинематографические пленки памяти.
- В колледже Уэстон префекты P4 убивают Деррика Ардена за подлость и шантаж, после чего обращаются к Гробовщику для сокрытия преступления.
- Главная глубинная тайна вселенной: имя «Сиэль» принадлежит не главному герою, а его погибшему брату-близнецу; протагонист присвоил себе чужую личность после трагедии на алтаре, что придаёт контракту с демоном ещё более трагический и греховный контекст.