Ход событий и ключевые твисты:
- Предыстория: В начале фильма показан флешбэк из 1980-х: девочка Шарлотта (дочь Генри Эмили, совладельца бизнеса) становится первой жертвой Уильяма Афтона возле пиццерии. Её дух вселяется в куклу Марионетку.
- Основной конфликт: В настоящем времени Эбби сбегает в заброшенное здание старой пиццерии. Марионетка манипулирует Эбби и вынуждает Ванессу раскрыть пароль сброса периметральных ограничений безопасности.
- Прорыв аниматроников: Получив свободу, Toy-аниматроники (Toy Freddy, Toy Bonnie, Toy Chica, Mangle), подвластные Марионетке, вырываются на улицы города, чтобы убивать любых взрослых в качестве мести.
- Борьба за Эбби: Марионетка вселяется в Эбби. Майк спасает сестру, активировав старинную музыкальную шкатулку Генри Эмили, мелодия которой умиротворяет дух Шарлотты и выгоняет её из тела девочки.
- Раскрытие Майкла Афтона: Выясняется, что полицейский Майкл — тайный сын Уильяма Афтона и брат Ванессы, стремящийся продолжить кровавую «династию» отца.
- Кульминация: Классические аниматроники (Фредди, Бонни, Чика, Фокси) из первого фильма прибывают к дому Майка и вступают в схватку с Toy-аниматрониками и Майклом.
- Шокирующая концовка (Клиффхэнгер): Майк, больше не способный доверять Ванессе из-за её тайн, просит её уйти. Одинокая и эмоционально сломленная Ванесса стоит на пороге, где в неё вселяется дух Шарлотты (Марионетки). Лицо Ванессы начинает изменять форму, принимая черты маски Марионетки — она становится новым сосудом для мстительного духа. В сцене после титров тизерится подготовка к событиям Five Nights at Freddy's 3.