Главный твист фильма заключается в личности Тома Реддла. Анаграмма «Tom Marvolo Riddle — I am Lord Voldemort» раскрывает, что «память» студента на самом деле является фрагментом души Волан-де-Морта (крестражем, хотя термин еще не используется). Тайную комнату открыл не Хагрид (как считалось 50 лет назад), а Реддл.
Второй слой: Джинни Уизли открывала комнату и писала угрозы на стенах, находясь под гипнотическим контролем дневника. Люциус Малфой подбросил дневник Джинни в начале фильма, чтобы дискредитировать её отца. Победа Гарри над василиском с помощью меча Гриффиндора доказывает его истинную принадлежность к этому факультету, разрешая его внутренний конфликт.