Что такое капсула. Тесная кабина, в которой Колтер приходит в себя между заходами, — не реальное помещение, а конструкция его собственного сознания, интерфейс, который мозг выстроил, чтобы справиться с происходящим. Именно поэтому она постепенно разрушается и меняется по мере того, как герой приближается к правде.
Главный твист: Колтер мёртв. Капитан Колтер Стивенс погиб двумя месяцами ранее в Афганистане. От него осталась половина тела, поддерживаемая аппаратурой в лаборатории проекта: обгоревший торс с уцелевшим мозгом, подключённый к системе жизнеобеспечения. Все разговоры о возвращении в часть и о звонке отцу были для Рутледжа управляющей ложью — «морковкой», которой мотивировали оператора. Гудвин в итоге показывает ему правду через монитор, и сцена с собственным телом становится центральным ударом фильма.
Что на самом деле умеет «Исходный код». Рутледж считает, что программа лишь считывает восьмиминутный след кратковременной памяти погибшего пассажира — то есть работает с прошлым, которое нельзя изменить, «не путешествие во времени, а переназначение времени». Он ошибается. Каждый заход открывает — или создаёт — самостоятельную параллельную реальность, в которой действия Колтера имеют настоящие последствия. Дункан Джонс подтверждал именно это прочтение: герой не переписывает свой мир, а перемещается в новый.
Бомбист. Виновник — Дерек Фрост, пассажир того же вагона, взорвавший поезд как «пристрелку» перед главной атакой: грузовиком с грязной бомбой он собирался ударить по центру Чикаго. Колтер вычисляет его через фургон на парковке у станции и в одном из заходов останавливает, передав информацию наружу; в реальности фильма это спасает город.
Двойная сделка финала. Выполнив задание, Колтер просит Гудвин о двух вещах: отправить его в поезд ещё один, последний раз — и после этого отключить аппаратуру, не позволив Рутледжу стереть ему память и использовать снова. Гудвин идёт на прямое нарушение приказа и выполняет обе просьбы.
Финальный заход. В последние восемь минут Колтер не ищет бомбу — он уже обезвредил Фроста. Он звонит отцу, представившись сослуживцем сына, и говорит то, что не успел сказать при жизни; успокаивает пассажиров; заставляет весь вагон смеяться над шуткой комика и целует Кристину. Кадр замирает ровно на секунде взрыва — и взрыва не происходит.
Концовка. В той реальности поезд не взрывается. Колтер продолжает существовать в теле Шона Фентресса: он выходит с Кристиной в Чикаго, ведёт её к Cloud Gate и отправляет сообщение Гудвин этого мира — той, которая ещё не запускала программу, — предупреждая, что теракт предотвращён и что «Исходный код» работает лучше, чем она думает. Круг замыкается: в новом мире Колтер жив, теракта не было, а Гудвин получает шанс распорядиться технологией иначе.
Скрытые смыслы, читаемые только на второй просмотр. Реплика «Everything's going to be okay» из ритуальной формулы утешения превращается в буквальное обещание, которое герой исполняет. Мотив отражений — от окна вагона до зеркала и до зеркальной скульптуры — с самого начала подсказывает, что фильм не о путешествии во времени, а о версиях реальности. Костыль Рутледжа и капсула Колтера рифмуются как два образа повреждённости: один человек управляет программой, второй ею является. И наконец, тёмная сторона хеппи-энда: Колтер получает жизнь Шона Фентресса целиком — фильм оставляет вопрос о цене этого счастья открытым, ни разу не проговаривая его вслух.