Ключевой сюжетный поворот фильма заключается в том, что Марни — это не призрак и не плод воображения в чистом виде, а бабушка Анны. События, которые Анна переживает вместе с Марни, являются ее подсознательной реконструкцией историй, которые Марни рассказывала ей, когда Анна была совсем маленькой, до смерти бабушки. Это объясняет, почему Анна "вспоминает" детали жизни Марни, которые она не могла знать.
Марни вышла замуж за друга детства Кадзухико, и у них родилась дочь Эмили. Кадзухико погиб, а Марни, страдая от депрессии, была вынуждена отправить Эмили в интернат, а сама легла в санаторий. Эмили выросла, вышла замуж, и у нее родилась Анна. Однако Эмили и ее муж погибли в автокатастрофе, когда Анна была маленькой. Марни, уже пожилая, взяла Анну к себе, но вскоре и сама умерла от горя. Таким образом, Анна пережила тройную потерю: родителей, а затем и бабушки, которая была ее последней кровной родственницей.
Это знание полностью меняет восприятие фильма. Становится понятно, что глубокое чувство покинутости у Анны имеет под собой реальную почву. Ее дружба с "воображаемой" Марни — это терапевтический процесс, в ходе которого она заново знакомится со своей бабушкой, понимает ее собственную боль и одиночество, и, наконец, прощает ее за то, что та ее "оставила". Финальная сцена, где Анна прощается с Марни в окне, символизирует ее окончательное примирение с прошлым и готовность двигаться дальше, приняв любовь своей приемной семьи.