Ключевым сюжетным поворотом и главной тайной всего сериала является личность "Why-man" (Почемучки) — источника окаменения. На протяжении большей части истории герои считают, что это некий злой гений или инопланетная сущность, передающая свои сообщения голосом Сэнку. Финальная арка манги (которая будет экранизирована в будущих сезонах) раскрывает, что Why-man — это рой механических паразитов на основе искусственного интеллекта, которые были созданы неизвестной инопланетной цивилизацией. Их цель — достичь бессмертия для разумных видов, "даря" им окаменение, которое останавливает старение и защищает от опасностей, тем самым делая их вечными. Они считают это высшим благом и не могут понять, почему человечество отказывается от такого "подарка".
Эта разгадка полностью меняет восприятие конфликта. Антагонист оказывается не злодеем в классическом понимании, а формой жизни с абсолютно чуждой логикой. Он не желает зла, а предлагает бессмертие, не понимая ценности жизни, роста и перемен для людей. Финальное противостояние Сэнку и Why-man'а — это не битва на уничтожение, а научный диалог, в котором Сэнку должен доказать, что прелесть жизни заключается именно в ее конечности, в борьбе и развитии. В конечном итоге, Сэнку не уничтожает Why-man'а, а предлагает ему сделку: оставить человечество в покое и поселиться на Луне, где люди будут его изучать, что удовлетворяет его потребность в общении с интеллектом. Эта концовка подчеркивает главную идею сериала: даже самые глобальные проблемы можно решить с помощью науки, диалога и понимания, а не грубой силы.
Другой важный аспект, который становится понятен после полного просмотра, — это колоссальное значение миссии Бякуи Исигами и других астронавтов. Их "Сто сказаний" были не просто историями для выживания, а продуманным планом по сохранению человечества и передаче ключевых знаний, которые в итоге стали фундаментом для Царства Науки Сэнку. Весь сериал — это история о двух поколениях Исигами, отце и сыне, которые, будучи разделенными тысячелетиями, работали вместе, чтобы спасти человечество.