Смерть Балдуина и распад мира. Прокажённый король — последний гарант равновесия. После его смерти власть переходит к Сибилле и её мужу Ги де Лузиньяну, и хрупкий мир рушится. Фанатики и честолюбцы провоцируют войну с Саладином.
Трагедия Сибиллы. В режиссёрской версии важна сюжетная линия сына Сибиллы, наследника престола. Мальчик унаследовал проказу, и мать, спасая его от медленной мучительной смерти, делает немыслимый выбор. Этот глубоко трагичный момент концентрирует главный конфликт фильма: личное против общего, любовь против долга. Без этой линии поступки Сибиллы в прокатной версии выглядят куда менее мотивированными.
Отказ от власти. Балиану предлагают путь к власти, но для этого нужно пойти на бесчестие. Он отказывается. Именно этот отказ позволяет Ги повести армию в губительный поход. Фильм не упрощает ситуацию: чистые руки героя тоже имеют цену.
Разгром и пленение Ги. Христианская армия уничтожена. В шатре Саладина звучит реплика «A king does not kill a king», противопоставляющая Ги покойному Балдуину.
Осада Иерусалима. Балиан, оставшийся без армии, посвящает в рыцари простых людей, способных держать оружие, и возглавляет оборону. В этом суть его пути: благородство даётся не рождением. Защищает он не святыни, а людей.
Сдача города. На переговорах Балиан угрожает сжечь всё, что «сводит людей с ума», и добивается безопасного выхода для жителей. Саладин соглашается и подчёркивает, что он не такой, как крестоносцы, некогда устроившие резню. Обмен «Ничто. Всё» раскрывает смысл: город бесценен как символ и ничего не стоит по сравнению с жизнями.
Финал. Балиан возвращается во Францию к простой жизни, а мимо проезжают новые крестоносцы, идущие отвоёвывать Иерусалим. Он отказывается к ним присоединиться. Этот горько-ироничный финал показывает, что круг насилия продолжается, а «Царство Небесное» герой нашёл не в Иерусалиме, а в собственной совести.